| 交通运输部水运科学研究院>港航运行中心 | 信息系统建设 | 0503 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：计算机科学与技术(0812)、信息与通信工程(0810) | 仅限博士研究生 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>部环保中心 | 生态科研咨询 | 0504 | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：建筑(085100)、建筑学(081300)；一级学科：研究生：建筑学(0851)、建筑学(0813)、风景园林(0862) | 硕士研究生及以上 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>海事中心 | 应用软件开发 | 0505 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：计算机科学与技术(0812)、控制科学与工程(0811)、交通运输工程(0823)、船舶与海洋工程(0824) | 硕士研究生及以上 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>电控中心 | 数智技术研究 | 0506 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：控制科学与工程(0811)、计算机科学与技术(0812) | 仅限博士研究生 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>质量中心 | 港航安全与应急技术研究 | 0507 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：化学工程与技术(0817)、水利工程(0815) | 仅限博士研究生 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>船舶中心 | 船舶运输技术研究 | 0508 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：交通运输(0861)、机械(0855)、机械工程(0802)、船舶与海洋工程(0824)、能源动力(0858) | 硕士研究生及以上 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>物流中心 | 综合交通与现代物流技术 | 0509 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：交通运输工程(0823) | 仅限博士研究生 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>交流中心 | 标准化研究 | 0510 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：交通运输工程(0823)、交通运输(0861)、管理科学与工程(1201)、仪器科学与技术(0804)、法学(0301) | 仅限博士研究生 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>港航运行中心 | 运行数据分析 | 0511 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：数学(0701)、计算机科学与技术(0812) | 仅限博士研究生 | 北京市 | 详情 |
| 交通运输部水运科学研究院>溢油中心 | 海洋污染防治技术咨询与服务 | 0512 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：海洋科学(0707)、环境科学与工程(0830) | 仅限博士研究生 | 天津市 | 详情 |