| 自然资源部第三海洋研究所 | 近岸水文动力研究 | 1921 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：海洋科学(0707)、水利工程(0815) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 海洋声学研究 | 1922 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：物理学(0702)、海洋科学(0707)、信息与通信工程(0810)、计算机科学与技术(0812)、船舶与海洋工程(0824) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 海洋遥感研究 | 1923 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：物理学(0702)、地理学(0705)、海洋科学(0707)、计算机科学与技术(0812)、测绘科学与技术(0816) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 同位素技术研发与应用 | 1924 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：仪器科学与技术(0804)、控制科学与工程(0811)、软件工程(0835) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 深海生物遗传资源探采与开发利用 | 1925 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：海洋科学(0707)、生物学(0710)、环境科学与工程(0830)、生物工程(0836)、生物与医药(0860) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 滨海湿地生态修复研究及应用 | 1926 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：地理学(0705)、海洋科学(0707)、生物学(0710)、生态学(0713)、环境科学与工程(0830)、资源与环境(0857)、植物保护(0904)、水产(0908) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 珊瑚礁生态学研究 | 1927 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：海洋科学(0707)、生物学(0710)、生态学(0713)、环境科学与工程(0830) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 海洋生物酶应用研究 | 1928 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：生物学(0710)、生物工程(0836)、基础医学(1001)、药学(1007) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 海洋微生物资源应用研究 | 1929 | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：海洋科学(0707)、生物学(0710)、生物工程(0836)、水产(0908) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |
| 自然资源部第三海洋研究所 | 海洋生态动力学模型研发 | 1930 | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：流体力学(080103)；一级学科：研究生：数学(0701)、大气科学(0706)、海洋科学(0707)、生态学(0713) | 仅限博士研究生 | 厦门市 | 详情 |